窝沟内很适合细菌生长繁殖，致龋菌在窝沟内，利用食物中的糖类(碳水化合物)生长繁殖，并在代谢过程中产生酸性物质，腐蚀牙齿，形成龋洞，这就是窝沟龋。一旦发生窝沟龋，破坏可向深部迅速扩展，形成外观小而内部破坏很大的龋洞。
六龄齿宜早做窝沟封闭
东莞博球口腔医生指出大约90%的青少年龋齿属于窝沟龋。如果能有效地预防窝沟龋的发生，就能在很大程度上降低儿童龋病的患病水平，提高成人后的口腔健康水平。
在发生窝沟龋的牙齿中，六龄齿较易发生龋变，这主要因为：
第一，六龄齿在牙齿中利用率较高，而儿童往往不能自觉主动地注意口腔卫生。而刚萌出的牙齿尚未发育完全，表面钙化不足，耐酸性差，所以很容易发生龋变，且很容易向深层发展，导致牙髓炎等。
第二，六龄齿的咬合面有许多相对于其他恒牙都深的小窝和沟裂，牙菌斑和食物碎屑隐藏在这些小窝中，很难通过儿童自己刷牙清除。
第三，儿童饮食中糖类食品占的比例较大，这些食物可促进致龋相关细菌的生长繁殖。
六龄齿窝沟封闭约在6岁左右进行，而理想的窝沟封闭不仅只做六龄齿，在3至4岁时可以给乳磨牙做一次，12岁左右给双尖牙和第二恒磨牙做一次，部分窝沟较深的青年人也可以窝沟封闭防龋。
